El clima de la región del lago Titicaca es extremo, con grandes variaciones de temperatura entre el día y la noche. La temporada ideal para visitarlo es entre septiembre y enero, época en que los días son soleados, las lluvias muy raras y la temperatura diurna alcanza los 25 °C. Las noches son siempre frías. Por eso se hace el lago más navegable y también sirve para competencias acuáticas.

Este lago ofrece una variada fauna compuesta principalmente de patos, peces tales como el suche, el carachi y la trucha (introducida), así como alpacas y llamas entre otros. En el lago existe una especie conocida como "rana gigante del lago Titicaca" (Telmatobius culeus), siendo el lago el único hábitat de esta especie.

La vegetación del lago se clasifica en anfibia, sumergida y flotante, y compone uno de los principales elementos del ciclo del ecosistema. Su flora está representada por 12 variedades de plantas acuáticas resaltando la totora (Scirpus californicus), la yana llacho (Elodea potamogeton), la lenteja de agua (Lemna sp.) y la purima (Chara sp.). La Reserva presenta también flora terrestre ribereña con más de 64 géneros.

Este lago se encuentra en el altiplano andino, en la frontera entre Perú y Bolivia. Su superficie abarca unos 9000 kilómetros cuadrados y se halla a unos 3800 metros sobre el nivel del mar. Su profundidad máxima se estima que es de unos 460 metros.

Para ser exactos decimos que tiene 3.810 m de altitud, y además de ser el lago más inmenso de América Latina es también el lago navegable más alto del mundo. Este lago sagrado alberga más de una treintena de islas que pueden visitarse en una de las embarcaciones de los lugareños.

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